Der Wasserzulauf beginnt am Pfarrgarten der Abteikirche (Höhe Feuerwehrhaus der Freiwilligen Feuerwehr Sayn). Dort wird das Wasser des Brexbaches durch eine Pfalz gestaut und in das Einlaufwehr des Mühlgrabens geleitet. Nach verbrieftem Wasserrecht, das zur Mühle gehört, darf 2/3 des Wassers zum Betreiben der Hein‘s Mühle aus dem Brexbach entnommen werden. Es legt vom Wehr eine Strecke von zirka 350 Meter zurück bis zum Einlauf auf das Wasserrad und läuft dann 60 Meter unterirdisch wieder in den Brexbach.
Die Wasserkraft kleinerer Bäche ließ sich am besten mit oberschlächtigen Wasserrädern nutzen. Die Hein‘s Mühle wird von einem rücken/mittelschlächtigen Wasserrad angetrieben. Dabei fließt das Wasser in die Zellen des Rades ein. Der Wassereinlauf liegt zwischen Radscheitel oben und der Radmitte. Der Wassereinlauf der Hein‘s Mühle auf das Wasserrad wird durch eine Eisenklappe, die vom ersten Stock aus mittels eines Hebels in der Mühle zu bedienen ist, erreicht. Die Heins Mühle ist als einzige von ehemals über zwanzig Wassermühlen im Umkreis von Bendorf erhalten geblieben.
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